We wczesnym średniowieczu powstała najwcześniejsza infrastruktura portowa na wybrzeżu gdańskim. W XII i XIII wieku powstał port Starego Miasta. W okresie panowania Krzyżaków, magazyny portowe przeniesiono na Wyspę Spichrzów gdzie powstał największy dźwig średniowieczny czyli Żuraw. Przy nabrzeżach w roku 1643 istniała imponująca liczba 315 spichlerzy gdzie głównie przeładowywano zboże. Jednak później w okresie zaborów port gdański stracił na znaczeniu. Dopiero po okresie I wojny światowej port znowu zaczął się rozwijać i przynosić olbrzymie zyski.
Obecnie w Gdańsku znajdują się dwa porty: Port Północny, z bezpośrednim dostępem do Zatoki Gdańskiej oraz Port Wewnętrzny, usytuowany wzdłuż Martwej Wisły. Największy port kontenerowy Bałtyku znajduje się właśnie w Gdańsku. Tereny portu Gdańsk znajdują się w obszarach takich dzielnic jak: Nowy Port, Letnica, Młyniska, Śródmieście, Rudniki, Wyspa Sobieszewska, Krakowiec-Górki Zachodnie, Stogi i Przeróbka. Ruchem statków w porcie kieruje Kapitanat Portu Gdańsk.