18 października 2004 r. otrzymał tytuł Honorowego Obywatela Miasta Gdańska

Święcenia kapłańskie otrzymał w 1962 r. Studiował w Gdańskim Seminarium Duchownym i na KUL.
Od 1979 r. jest proboszczem parafii konkatedralnej Najświętszej Marii Panny w Gdańsku. Bazylika Mariacka w czasach PRL, kiedy jej proboszczem był Stanisław Bogdanowicz, była oparciem dla prześladowanych ludzi "Solidarności". Tu odbywały się msze patriotyczne 3 maja, 15 sierpnia i 11 listopada, które gromadziły liczne rzesze wiernych. Ksiądz infułat był także, jako młody ksiądz, więźniem politycznym.
Napisał 36 książek dotyczących historii oraz architektury i dziejów gdańskich kościołów.
Jest autorem monografii kościoła Mariackiego oraz dzieła „Kościół gdański pod rządami komunizmu”. Niebawem ukaże się najnowsza - "Czas burzenia - czas budowania; Kościół gdański w społeczeństwie odzyskującym wolność 1984-92". Jest zwolennikiem zwrotu zabytków sakralnych kościołom. Za jego sprawą do bazyliki wróciła większość dzieł rozproszonych po wojnie. Ksiądz Bogdanowicz - jako Stan Bogdan - pisze też bajki dla dzieci, m.in. "O małym Kostku i herbie Ferberów" czy "Baśnie gdańskie". Interesuje się sztuką gotyku i baroku, historią Gdańska, pedagogiką, psychologią i badaniem Biblii.
W latach 1997-2001 był członkiem Kapituły Medali Św. Wojciecha i Księcia Mściwoja nadawanych przez Radę Miasta Gdańska. W 2001 r. Kapituła odznaczyła ks. infułata medalem św. Wojciecha za całokształt dokonań związanych z popularyzacją dziejów Gdańska, szczególnie gdańskiego kościoła i podejmowanych działań na rzecz ocalenia gdańskich zabytków.
Od wielu lat jest kapelanem kombatantów, w tym także byłych więźniów politycznych z lat 1980-1990 zrzeszonych w Stowarzyszeniu „Godność”. Związany jest z ruchem Akcji Katolickiej.